Baptiste Stalin prépare depuis 2024, sous la direction d’Isabelle Rosé, une thèse de doctorat en histoire médiévale sur les « pratiques de l’écrit et réseaux de pouvoirs de l’abbaye de Fleury du VIIIᵉ au XIIᵉ siècle ».
Ses recherches portent sur les réseaux monastiques, personnels et institutionnels, et sur l’influence de l’abbaye ligérienne, analysée à partir de ses productions écrites et de la diffusion de ses œuvres hagiographiques et historiographiques dans les bibliothèques médiévales.
Ses travaux reposent sur l’utilisation de méthodes et d’outils cartographiques et d’analyse des réseaux issues des humanités numériques.
Il bénéficie d’un contrat doctoral d’établissement.